Anthropic afirma que su modelo de IA Claude ha encontrado un sistema de proteínas que se asemeja a Crispr. La compañía afirma que Claude detectó una enzima con propiedades «reminiscentes de Crispr», la herramienta de edición genética galardonada con el Premio Nobel, después de buscar en enormes bases de datos genómicas en busca de reverse transcriptasas inusuales.
Anthropic hizo el anuncio el 23 de septiembre, y se refería a un experimento con agentes de Claude. La compañía dice que aproximadamente 950 de esos agentes se ejecutaron simultáneamente y descubrieron las secuencias genéticas interesantes en 21,5 horas.
Cómo Anthropic Encontró el Sistema
Se le indicó a Claude por el equipo de Anthropic que examinara extensos archivos genómicos en busca de ejemplos de reverse transcriptasas, el tema de la marca «nuevos ejemplos interesantes». Estas proteínas funcionan copiando ARN en ADN, lo que va en contra de la secuencia celular habitual en la que el ADN se convierte en ARN. Las reverse transcriptasas cumplen una serie de funciones en otras especies, como colocar segmentos de ADN dentro del material genético de un organismo.
Anthropic dice que Claude encontró inicialmente más de 200.000 posibles reverse transcriptasas. De esos miles, el modelo luego se centró en una «inusual» familia de reverse transcriptasas con una larga serie de ADN repetido que se parece mucho a Crispr. Ese sistema ha sido nombrado ART, que significa reverse transcriptasas asociadas a arreglos, por Anthropic. Se encuentra dentro de fagos gigantes, que son virus grandes que atacan a las bacterias.
Un agente de IA escribió: «Puedo ver a simple vista un arreglo de repeticiones tándem… ¡¡eso es como Crispr… un arreglo de repeticiones?!» El agente también reconoció que este sistema podría ser un retron, como se señaló en el informe técnico. Crispr y los retrons son ambos sistemas inmunitarios bacterianos, aunque los retrons no son la misma herramienta integral que es Crispr.
Reacciones de Expertos en Edición Genética
Fyodor Urnov, experto en edición genética de la Universidad de California, Berkeley y director de I+D terapéutica de su Instituto de Genómica Innovadora, ofreció palabras de elogio. «Sinceramente felicito a Anthropic por informar al mundo sobre su descubrimiento», dijo. IGI está colaborando con Anthropic pero no participó en el nuevo descubrimiento.
No todo el mundo quedó impresionado. «Los experimentos todavía están en la cola. La campaña de relaciones públicas ya está en marcha», afirma Le Cong, profesor de la Universidad de Stanford que se enfoca en la integración de la IA en la investigación de ingeniería genómica.
Anthropic ha establecido un laboratorio húmedo para el descubrimiento de fármacos. La compañía admite que aún no comprende lo que hace el sistema. («Aún no entendemos lo que hace este sistema», dijo la compañía en una publicación de X), «pero solo un puñado de sistemas conocidos comparten sus características, y todos ellos son capaces de cortar, copiar y pegar ADN.») Un experimento físico fue incluido en un informe técnico, que aún no ha sido revisado por pares.
El Diamante en la Playa de Santa Mónica
Cong enmarcó el descubrimiento como un problema de búsqueda. «Digamos que estamos en la Playa de Santa Mónica e intentando escanear toda la arena para encontrar un diamante», dice. «La IA encontró algo que parece muy brillante, y entonces tienes que regresar al laboratorio para saber: ¿es vidrio? ¿Es un diamante?»
Marca la diferencia la forma en que lo mires. Claude encontró algo que se asemeja a Crispr. La cuestión de si el sistema enzimático puede cortar ADN aún está por determinarse. La pregunta de si se puede utilizar como una herramienta de edición de genes, y de ser así, si resulta ser una herramienta útil, permanece abierta.
Lo Que Claude Realmente Hizo
El papel de Claude fue el reconocimiento de patrones. Identificar nuevas transcriptasas inversas puede llevar meses de minería manual de bases de datos genómicas, por lo que Shipman dice que la capacidad de Anthropic para hacer esto en un día es impresionante. Pero advierte contra la atribución del descubrimiento por completo a un modelo de IA. «Creo que debemos tener cuidado al decir que Claude descubrió algo de forma autónoma, porque hay científicos involucrados en el estudio», dice.
Jason Gill, un microbiólogo de la Universidad de Texas A&M, y sus colegas identificaron por primera vez la misma transcriptasa inversa en un documento de 2021 sobre fagos jumbo. El nuevo desarrollo proviene de Claude, quien encontró repeticiones alrededor de la enzima que sugirieron que podría ser parte de un sistema similar a Crispr.
«Estos modelos son buenos para encontrar patrones, mejor que una persona mirándolo fijamente con sus propios ojos», dice Gill. «Una persona podría hacer todo esto, pero ya tienes que tener una hipótesis en mente.» Él añade que ART parece no tener ninguna «relación obvia» con ningún sistema Crispr conocido, y le corresponde a Anthropic demostrar que realmente tiene actividad de edición genética.
«Lo novedoso es cómo lo encontraron, no qué es.»
Los sistemas de edición genética basados en retronas ya han sido desarrollados por el laboratorio de Shipman, lo que significa que las retronas pueden ser empleadas de esta manera.
La Pregunta de Entrenamiento
La comunidad científica no puede juzgar en qué fue entrenado Claude, lo que significa que los hallazgos carecen de transparencia en un momento en que los principales revistas exigen que los investigadores pongan su código a disposición gratuita para que otros científicos puedan reproducir su trabajo.
Un investigador que había dedicado años a estas enzimas específicas se preocupó de que el modelo hubiera aprendido de su investigación, después de que él hiciera públicos resultados aún no publicados a través de la versión pública de Claude. («Claude no fue», Anthropic confirmó esto al New York Times, «entrenado con ninguna transcripción de usuario, y nuestro equipo de biología molecular tampoco tiene ese acceso.»)
La Prueba de Laboratorio por Delante
Todavía se necesitaría que científicos humanos realizaran pruebas en el laboratorio para probar el próximo gran avance en la edición genética, incluso si Claude lo identificó primero. El director ejecutivo de Anthropic, Dario Amodei, reflexionó sobre esto en X en una publicación sobre el descubrimiento, «Eventualmente, incluso podría ser posible para Claude mismo realizar de forma segura los experimentos controlando de forma autónoma el equipo de laboratorio.»
El resultado sigue siendo un mero patrón en el presente, no una prueba. La distancia a ese futuro es considerable. Algo parecido a Crispr apareció a Claude. Se requerirá confirmación por parte de humanos.
Lo Que Hacemos Con Esto
Lo que destaca del anuncio es el método, no el descubrimiento en sí mismo. Claude localizó un elemento raro entre innumerables posibilidades con una velocidad que superó la de un humano.
Es comprensible que personas como Cong tengan dudas. El informe no ha sido revisado por expertos externos. En lugar de encontrar la enzima directamente, la función de edición genética del sistema permanece sin probar. Y el patrón que Claude encontró ya fue documentado en un artículo de 2021, lo que significa que Claude no simplemente encontró los repeticiones circundantes que lo rodean.
La opacidad de los datos de entrenamiento de Claude es una preocupación real. La sospecha de un investigador y la negación de Anthropic plantean preguntas sobre la reproducibilidad y el crédito. La negativa de la empresa al New York Times no es un sustituto de la transparencia.
El argumento de Shipman se mantiene vigente: lo que importa es el enfoque, no el químico en sí. Claude destaca por encontrar patrones, pero esa habilidad no puede sustituir el trabajo de laboratorio real.
La noticia de Anthropic sirve como un recordatorio de que la IA opera como una herramienta en lugar de un sustituto de la toma de decisiones humanas.
Material fuente: “Anthropic Says It Discovered a Crispr-Like System. Now What?,” WIRED.
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